viernes, 8 de marzo de 2013

Conceptos básicos de la transcripción y transcripción en procariontes

Transcripción: ARN polimerasa, promotor y ARN

Promotor: secuencia en la región 5' del ADN a la que se une la ARN polimerasa para iniciar la transcripción. La transcripción se inicia en el sitio de iniciación, que es el punto +1. Todo lo que se encuentre delante de este punto, incluyendo al promotor se conoce como aguas arriba (y sus nºs de localización son negativos) y lo que se encuentre detrás aguas abajo y sus números de localización son positivos.
Aguas arriba (-)    Sitio de iniciación      Aguas abajo (+)
                                        Promotor                     +1
ARN polimerasa: Es la enzima encargada de la lectura del ADN para la polimerización del ARNm. Carece capacidad correctora porque un daño en el ARN no es tan definitivo como un daño en la replicación del ADN y además no emplea cebadores.

ARNm: Contiene la secuencia que va a determinar la secuencia de aminoácidos de la proteína sintetizada.
ARNr: Tienen función estructura, pues junto con las proteínas da lugar al ribosoma (donde se realiza la traducción).
ARNt:Es el responsable de acercar los aminoácidos correctos al ribosoma para la síntesis proteica.
MicroARN: Tiene función reguladora, por ejemplo, regular el ARNm.
SiARN (ARN pequeño de interferencia): Tiene función protectora del genoma.

El ARN es una molécula mucho más flexible que el ADN porque carece de las interacciones débiles y puentes de hidrógeno de este. Además se suele unir a proteínas formando ribonucleoproteínas.

¿Cómo se inicia la transcripción?
Una holoenzima de ARN polimerasa se une al ADN, lo desenrolla y lo va transcribiendo. Cuando termina de transcribir esa sección lo enrolla y se mueve a la siguiente porción de ARN que quiere transcribir.

Transcripción en procariontes: Factor sigma
Las bacterias pueden realizar la transcripción sin el factor sigma, pero no reconocer al promotor. Hay distintos factores sigma, unos más predominantes que otros y con funciones específicas, lo que permite discriminar entre todos los promotores el promotor que en un determinado momento nos interesa.
Todos los promotores poseen un lugar rico en A y T, que son zonas de interacciones débiles por lo que son fáciles de rompe. Sigma palpa el ADN en el surco mayor y dispara el proceso de transcripción.
El factor sigma es un mecanismo de regulación, que junto con otros permite el ahorro de energía a la bacteria:
  1. No todos los promotores tienen la misma importancia o función, así que la ARN polimerasa debe unirse específicamente a aquel que interesa.
  2. El ARNm de las bacterias es policistrónico, es decir, a partir de un ARNm puede sintetizar varios genes.
  3. La transcripción es simultánea a la traducción.
  4. Las bacterias tienen mecanismos que indican cuando es el momento de parar correcto. Se forma una horquilla por apareamiento de bases que impide la transcripción a la ARN polimerasa. En E. coli este lazo u horquilla es lo suficientemente fuerte para parar a la ARN polimerasa, pero no para liberarla, de lo que se encarga la proteína Rho.